154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1297 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  100 
 
 
188 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  95.21 
 
 
188 aa  333  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  72.87 
 
 
188 aa  279  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  72.73 
 
 
176 aa  267  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  62.64 
 
 
174 aa  222  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  66.45 
 
 
164 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  58.76 
 
 
175 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  50.32 
 
 
179 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  47.89 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  46.81 
 
 
186 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  45.57 
 
 
199 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  46.63 
 
 
199 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  45.08 
 
 
207 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  38.8 
 
 
190 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  45.98 
 
 
178 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  40.86 
 
 
231 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.43 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.23 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  37.43 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  37.43 
 
 
184 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  37.43 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  36.84 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  47.31 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  36.84 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  36.84 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  36.84 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  46.26 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  45.22 
 
 
183 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  45.45 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.29 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  53.23 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  45.45 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  45.45 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  41.26 
 
 
159 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  47.47 
 
 
185 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  43.8 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  48.37 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  42.98 
 
 
159 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  36.9 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  40.28 
 
 
189 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  45.56 
 
 
178 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  39.86 
 
 
173 aa  104  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  41.71 
 
 
182 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  45.76 
 
 
120 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.53 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.3 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 
325 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  39.47 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  43.94 
 
 
152 aa  94.4  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  44.59 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  44.59 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  44.59 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  38.06 
 
 
167 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  43.95 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  42.04 
 
 
182 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  43.95 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  44.59 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  43.95 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  43.95 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  41.56 
 
 
169 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  49.04 
 
 
156 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  40.71 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 
405 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 
405 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  39.37 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  43.27 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  38.19 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  40.32 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  33.15 
 
 
383 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  31.07 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  37.84 
 
 
324 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  40.5 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  34.16 
 
 
307 aa  77.8  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.62 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36.91 
 
 
301 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  43.9 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
410 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  38.66 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  31.46 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  37.9 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  40.4 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  42.4 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  37.1 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.1 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.98 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
373 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  39.68 
 
 
285 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.81 
 
 
394 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.53 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  37.1 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  47.62 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  40.31 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>