154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3090 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  100 
 
 
159 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  100 
 
 
159 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  95.6 
 
 
159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  81.76 
 
 
159 aa  263  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  80.5 
 
 
159 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  79.87 
 
 
159 aa  260  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  54.19 
 
 
165 aa  163  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  51.33 
 
 
156 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  47.79 
 
 
152 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  43.92 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  54.7 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  41.72 
 
 
167 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  45.75 
 
 
184 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  45.1 
 
 
184 aa  121  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  45.1 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  45.1 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  45.75 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  45.1 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  45.1 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  46.4 
 
 
207 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  43.71 
 
 
169 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  45.83 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  45.45 
 
 
188 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  46.77 
 
 
173 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  43.33 
 
 
176 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  43.8 
 
 
188 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  40.25 
 
 
178 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  40 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  40.83 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  43.8 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.25 
 
 
189 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  37.2 
 
 
178 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.75 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  35.54 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  40.17 
 
 
190 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  38.58 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  45 
 
 
390 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  40.62 
 
 
373 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.17 
 
 
383 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  38.84 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.28 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  40.68 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  35.38 
 
 
186 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  37.25 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  37.7 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  36.08 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  30.2 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  33.33 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  38.28 
 
 
391 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  34.35 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 
344 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.43 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  32.68 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  36.73 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  28.24 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.33 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.98 
 
 
404 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  33.8 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  38.33 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 
410 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 
379 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  35.95 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  34.38 
 
 
379 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  42.86 
 
 
231 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
361 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  33.57 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  40.2 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  36.89 
 
 
376 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  37.16 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.22 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  33.33 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  37.8 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  42.37 
 
 
378 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  37.41 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  37.41 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  30.95 
 
 
324 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  32.73 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  32.73 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  32.73 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.54 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  36 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  32.73 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  32.73 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  33.07 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  32.12 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  33.33 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
420 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
449 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  35.83 
 
 
389 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
389 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  32.52 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  32.52 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  33.56 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>