153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3346 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  70.88 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  70.88 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  69.78 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  69.78 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  69.78 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  69.78 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  67.58 
 
 		 182 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  69.23 
 
 		 182 aa  237  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  70.33 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  52.2 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  50.82 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  48.09 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  51.88 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  54.44 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  52.25 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  48.1 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  52.25 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  50.94 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  44.17 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  44.51 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  42.35 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  45.3 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  44.32 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  46.63 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  42.46 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  42.46 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  48.35 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  40.98 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  44.97 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  42.46 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  42.46 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  39.44 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  41.21 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  40.78 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  40.78 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  43.41 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  40.22 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  40.22 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  43.11 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  40.34 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  49.62 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  40.88 
 
 		 383 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  41.71 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  42.86 
 
 		 379 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  48.82 
 
 		 323 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.99 
 
 		 373 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  40.88 
 
 		 379 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  40.88 
 
 		 379 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  43.31 
 
 		 391 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 		 379 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  51.59 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  38.99 
 
 		 361 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  39.78 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.42 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  44.03 
 
 		 301 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  41.71 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  47.93 
 
 		 368 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.74 
 
 		 378 aa  95.5  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  48.03 
 
 		 285 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  36.09 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  37.11 
 
 		 376 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  40.52 
 
 		 465 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  40.13 
 
 		 382 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 397 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  40.13 
 
 		 397 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 382 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  38.06 
 
 		 344 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  43.08 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.49 
 
 		 397 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  38.2 
 
 		 392 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  42.64 
 
 		 346 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38.99 
 
 		 387 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.37 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.38 
 
 		 238 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40.3 
 
 		 416 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  41.72 
 
 		 390 aa  84.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 394 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  42.04 
 
 		 373 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  37.84 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  33.9 
 
 		 404 aa  80.9  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  44.9 
 
 		 284 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  41.73 
 
 		 120 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.56 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.49 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  33.9 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  37.24 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 399 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  40.91 
 
 		 382 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  37.85 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  35.95 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  35.95 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  44.16 
 
 		 379 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>