153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2511 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  100 
 
 		 152 aa  295  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  76.19 
 
 		 157 aa  223  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  62.5 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  51.15 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  47.89 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  50.38 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  47.79 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  47.79 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  47.79 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  48.74 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  44.06 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  47.06 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  47.06 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  45.71 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  50.46 
 
 		 207 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  43.93 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  40.85 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  39.5 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  46.03 
 
 		 189 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  44.17 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  43.14 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  35.97 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  39.2 
 
 		 181 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  51.02 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  36.62 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  38.03 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.42 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  43.94 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  43.94 
 
 		 188 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  41.53 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  36.5 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  41.35 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  38.35 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  35.53 
 
 		 373 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.5 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  32.65 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  37.31 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  32.58 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  35.76 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  34.59 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.51 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  35.53 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  46.67 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  37.12 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  34.62 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 449 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  38.06 
 
 		 376 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  34.46 
 
 		 178 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  39.45 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  37.4 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  36.84 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.46 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  41.41 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 397 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  41.41 
 
 		 397 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 465 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  42.72 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.76 
 
 		 368 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.71 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  35.76 
 
 		 383 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  42.2 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  46.84 
 
 		 346 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 361 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  34.04 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  40.4 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  35.66 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  34.71 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  34.71 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  29.66 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 376 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.55 
 
 		 420 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  36.04 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  35.94 
 
 		 207 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  37.96 
 
 		 323 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  37.88 
 
 		 388 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  33.87 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  33.87 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  33.87 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  33.87 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  33.87 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  37.37 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  33.83 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>