253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5364 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  100 
 
 		 383 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  61.25 
 
 		 379 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  63.13 
 
 		 379 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  62.96 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  61.11 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  60.98 
 
 		 379 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  60.98 
 
 		 379 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  60.46 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  60.42 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  42.7 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  42.74 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 410 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 		 376 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  39.89 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  38.75 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  40.65 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  38.75 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  38.75 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  38.75 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  38.75 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  38.75 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  40.72 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.38 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  45.42 
 
 		 400 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.19 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  40.7 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40.05 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  40.43 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  43.98 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  38.44 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  39.51 
 
 		 346 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 		 376 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  38.42 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  35.42 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  35.73 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  34.1 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  35.45 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  34.38 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  34.49 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  34.16 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  36.79 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  34.39 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.34 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  34.4 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  40.44 
 
 		 238 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  40.08 
 
 		 231 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  28.28 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  39.44 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  38.92 
 
 		 194 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 180 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  37.33 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  37.36 
 
 		 199 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  35.54 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  38.36 
 
 		 180 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  37.65 
 
 		 199 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  38.8 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  35.61 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  37.76 
 
 		 164 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  39.49 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  39.88 
 
 		 185 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.2 
 
 		 189 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  43.07 
 
 		 182 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  39.31 
 
 		 207 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  38.16 
 
 		 183 aa  96.3  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  40 
 
 		 178 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  34.78 
 
 		 184 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  41.61 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  43.9 
 
 		 120 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 182 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  41.61 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.84 
 
 		 190 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  31.96 
 
 		 240 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.36 
 
 		 182 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  31.92 
 
 		 231 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  36.2 
 
 		 190 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  42.15 
 
 		 167 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>