152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4302 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  54.02 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  50 
 
 		 368 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  51.68 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  50.88 
 
 		 392 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  52.97 
 
 		 387 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  50.21 
 
 		 389 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  49.77 
 
 		 378 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  46.81 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 		 399 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  48.54 
 
 		 391 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  46.81 
 
 		 382 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  51.11 
 
 		 388 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  47.28 
 
 		 391 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  51.3 
 
 		 400 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  46.67 
 
 		 391 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  47.08 
 
 		 391 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  46.03 
 
 		 391 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  46.03 
 
 		 391 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 373 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  49.78 
 
 		 404 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  45.85 
 
 		 397 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  45.85 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  45.85 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  45.85 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  45.81 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  45.85 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  47.81 
 
 		 416 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  42.91 
 
 		 376 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  50 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  42.62 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  44.29 
 
 		 379 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  41.56 
 
 		 376 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 390 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  45.66 
 
 		 379 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  45.66 
 
 		 361 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  42.26 
 
 		 410 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  45.5 
 
 		 379 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  45.5 
 
 		 379 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  43.26 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  40.44 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 384 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  40.35 
 
 		 384 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  48.21 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 384 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  43.44 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  43.04 
 
 		 383 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  38.57 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  39.46 
 
 		 389 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  39.67 
 
 		 325 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 		 385 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.82 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  39.91 
 
 		 394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 		 449 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  45.57 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  38.21 
 
 		 301 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  38.29 
 
 		 404 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  40.09 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  39.47 
 
 		 194 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  41.1 
 
 		 164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  44.03 
 
 		 180 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  41.38 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  39.82 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  39.79 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  41.27 
 
 		 377 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  33.74 
 
 		 385 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  44.72 
 
 		 366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  33.74 
 
 		 385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  39.56 
 
 		 390 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  42.01 
 
 		 376 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  39.25 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  38.94 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  35.19 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  47.97 
 
 		 366 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  45.16 
 
 		 178 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  38.99 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  43.59 
 
 		 185 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  39.22 
 
 		 183 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  40.78 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  40.59 
 
 		 179 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  39.35 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  40.52 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.61 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  42.03 
 
 		 182 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  43.42 
 
 		 178 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  40.88 
 
 		 182 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  40.88 
 
 		 182 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.51 
 
 		 420 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  37.97 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  38.56 
 
 		 186 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  42.21 
 
 		 175 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  38.85 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  38.97 
 
 		 182 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  38.97 
 
 		 182 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  38.24 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  37.5 
 
 		 182 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  37.5 
 
 		 182 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  41.98 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>