153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0078 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  99.45 
 
 
182 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  98.9 
 
 
182 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  98.35 
 
 
182 aa  362  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  95.6 
 
 
182 aa  327  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  93.41 
 
 
182 aa  321  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  93.41 
 
 
182 aa  321  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  90.11 
 
 
182 aa  316  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 
182 aa  240  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  58.79 
 
 
183 aa  219  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  54.64 
 
 
184 aa  205  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  53.26 
 
 
179 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  56.67 
 
 
178 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  54.6 
 
 
175 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  53.16 
 
 
199 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  50 
 
 
199 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  48.09 
 
 
178 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  50.56 
 
 
186 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  49.06 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  52.8 
 
 
194 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  48.33 
 
 
178 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  43.81 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  46.34 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  44.44 
 
 
189 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  51.61 
 
 
190 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  44.63 
 
 
175 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  41.21 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  46.31 
 
 
202 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  42.86 
 
 
174 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  38.33 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  38.33 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.57 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  44.3 
 
 
301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  41.67 
 
 
176 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  41.48 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  45.31 
 
 
325 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  53.54 
 
 
285 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  39.04 
 
 
164 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  41.32 
 
 
188 aa  104  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  40.49 
 
 
373 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.99 
 
 
383 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.99 
 
 
379 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  44.03 
 
 
323 aa  101  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.62 
 
 
379 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.62 
 
 
379 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  44.59 
 
 
188 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  50.79 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  44.09 
 
 
391 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 
376 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  37.74 
 
 
379 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  38.12 
 
 
361 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  40.69 
 
 
378 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  47.11 
 
 
368 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  38.06 
 
 
207 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.91 
 
 
344 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  39.78 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  40.51 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  37.91 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 
376 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  38.67 
 
 
465 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  37.91 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  38.67 
 
 
382 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  38.67 
 
 
382 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  38.67 
 
 
397 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  38.67 
 
 
397 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  34.24 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  38 
 
 
397 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  43.22 
 
 
346 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  36.08 
 
 
404 aa  87.8  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38 
 
 
387 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  39.23 
 
 
324 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  40.91 
 
 
240 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 
392 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  37.59 
 
 
416 aa  84.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  41.09 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  37.14 
 
 
388 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  40.77 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  30.34 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  34.67 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  37.14 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  33.52 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  32.37 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  41.45 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  32.78 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>