155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3702 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  100 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  61.61 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  49.28 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  48.55 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  48.55 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  48.55 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  48.55 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  47.83 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  47.83 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  47.83 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  43.15 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  41.72 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  41.72 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  40 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  41.61 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  42.47 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  50.76 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  45.71 
 
 		 152 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  41.78 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  44.12 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  48.09 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  42.73 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  41.79 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36 
 
 		 153 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  46.22 
 
 		 373 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  44.74 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  37.1 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.91 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  36.2 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  45.9 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  50 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  41.67 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.24 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  34.18 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  42.15 
 
 		 383 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  43.33 
 
 		 344 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  42.31 
 
 		 376 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 394 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  35.29 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 325 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 		 390 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  41.04 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  40.26 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  40.83 
 
 		 379 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  38.06 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 199 aa  85.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.82 
 
 		 379 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.82 
 
 		 379 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37.42 
 
 		 449 aa  84.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  36.22 
 
 		 190 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  38.33 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  34 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  35.4 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.1 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 361 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  34.76 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  45.92 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  37.9 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  45.67 
 
 		 383 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  39.19 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  37.9 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  37.9 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  39.52 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  36.29 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  36.29 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  36.29 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  36.29 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.18 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  34.11 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  32.08 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  35.45 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  36.29 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  51.35 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  33.71 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  40.35 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  34.33 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  29.75 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  38.1 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  37.19 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  39.82 
 
 		 388 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  43.81 
 
 		 378 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  41.38 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  32.3 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  41.09 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  43.09 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 389 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  39.02 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  28.32 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  37.07 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  38.05 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  33.64 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  33.33 
 
 		 379 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 376 aa  67.4  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>