154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2162 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  100 
 
 		 169 aa  322  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  51.52 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  42.26 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  41.07 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  41.07 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  41.07 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  40.48 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  47.37 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  46.71 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  46.71 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  42.07 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  42.76 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  44.37 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  42.29 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  43.71 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  43.71 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  43.09 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  44.81 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  39.44 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  35.54 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  34.32 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  41.1 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  33.53 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  40.23 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  35.88 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  42.42 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  41.46 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  41.67 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  42.94 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  37.06 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  40 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  38.86 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  44.07 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  42.86 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  41.1 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  40.52 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  37.16 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  41.56 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.44 
 
 		 190 aa  98.2  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 		 199 aa  98.2  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  38.71 
 
 		 194 aa  97.1  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  37.98 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  37.35 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  40.74 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  36.26 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  34.52 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  39.89 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  37.91 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  37.91 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.17 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  37.36 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  39.01 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  37.36 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  37.36 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  38.46 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  38.46 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  37.43 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  35.14 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  39.24 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  38.2 
 
 		 202 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  42.48 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  40.13 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.15 
 
 		 325 aa  81.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.37 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  36.8 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  38.66 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  36.61 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  35.44 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  35.42 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 394 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.4 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  32.54 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.18 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  35.59 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 		 361 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.45 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  29.3 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  30.67 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  30.67 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  30.57 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  30.38 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  38.17 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 449 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  29.75 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  38.12 
 
 		 384 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>