152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3149 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  100 
 
 
165 aa  313  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.89 
 
 
184 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  39.86 
 
 
184 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  38.27 
 
 
184 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.27 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  38.27 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  39.86 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.27 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  38.27 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  43.4 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  35.25 
 
 
173 aa  94.4  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.72 
 
 
190 aa  94  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  44.2 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  37.76 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  43.48 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  39.16 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  40.56 
 
 
181 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
394 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  36.67 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  39.57 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
374 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  38.78 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  43.51 
 
 
383 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  39.16 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  46.61 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  38.78 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  42.86 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  40 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.24 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  32.65 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  35.81 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  35.81 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  35.14 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  45.69 
 
 
416 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  43.09 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  39.35 
 
 
344 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.76 
 
 
397 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.76 
 
 
397 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  42.76 
 
 
465 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  40.14 
 
 
379 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  42.76 
 
 
382 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  42.76 
 
 
397 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  42.76 
 
 
382 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  38.62 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  35.46 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  41.73 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  42.01 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  41.73 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  47.75 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  34.57 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  37.96 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  39.33 
 
 
373 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  44.35 
 
 
449 aa  73.9  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  42.76 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  39.35 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  55.13 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  33.79 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  34.48 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  34.09 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  29.24 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  46.03 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  33.79 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  40.61 
 
 
207 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  34.23 
 
 
185 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  40.5 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  37.91 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  35.57 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  43.45 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  39.87 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  43.36 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 
384 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  37.25 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  36.71 
 
 
384 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  48.31 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  40 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  42.65 
 
 
382 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  42.64 
 
 
391 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  41.32 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  36.22 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  41.18 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  39.47 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 
391 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  41.04 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  45.05 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  45.05 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  41.18 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  41.18 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  49.35 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
420 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  40.4 
 
 
391 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.44 
 
 
378 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  40.98 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
325 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>