154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2981 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  100 
 
 		 159 aa  313  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  97.48 
 
 		 159 aa  307  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  97.48 
 
 		 159 aa  306  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  81.76 
 
 		 159 aa  263  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  81.76 
 
 		 159 aa  263  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  259  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  57.89 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  51.68 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  51.15 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  47.33 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  44.44 
 
 		 184 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  43.79 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  50.43 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  42.47 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  46.71 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  45 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  44.09 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  46.88 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  43.8 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  37.66 
 
 		 174 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  37.32 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  37.91 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  42.18 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  38 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  42.98 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  35.53 
 
 		 189 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  39.49 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  39.87 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  33.33 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.18 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  37.8 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  40.17 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.62 
 
 		 390 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 		 394 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  32.89 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  31.54 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.97 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  34.97 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  34 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  38.28 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  32.93 
 
 		 383 aa  80.5  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.15 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  37.75 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  32.03 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  32.65 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  35.71 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  34.03 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 325 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  38.21 
 
 		 344 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  37.5 
 
 		 391 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  35.77 
 
 		 379 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  35.77 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  30.94 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  34.59 
 
 		 404 aa  74.7  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.77 
 
 		 379 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 374 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  32.47 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  33.12 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  32.24 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  36.29 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  31.29 
 
 		 324 aa  70.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 410 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  33.97 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  25.6 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  33.78 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  34.09 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  34.09 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  32.72 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  34.43 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  34.09 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  33.61 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  35.77 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  32.73 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  35.06 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  35.25 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  38.98 
 
 		 378 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  35.77 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  35.77 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  34.42 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  32.21 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  38.14 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  44 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  32.21 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  34.15 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>