153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001161 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  100 
 
 		 157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  76.19 
 
 		 152 aa  223  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  62.82 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  47.33 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  43.92 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  46.56 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  43.92 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  43.92 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  46.56 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  46.62 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  45.97 
 
 		 184 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  45.97 
 
 		 184 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  45.16 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  45.16 
 
 		 184 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  48.09 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.59 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  44.55 
 
 		 207 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  53 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  40.34 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  42.75 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  41.67 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  42.14 
 
 		 404 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  37.06 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  37.29 
 
 		 169 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.34 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  35.42 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.3 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  33.59 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  39.2 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  38.14 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 		 394 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  43.27 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  35.61 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  33.83 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  42.31 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  38.18 
 
 		 373 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  39.47 
 
 		 344 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  36.22 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  39.22 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.02 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.15 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  33.1 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  38.46 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  32.84 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 390 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  32.79 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.36 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  35.56 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  36.57 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 		 325 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.82 
 
 		 368 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  35.38 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  34.75 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 361 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  33.08 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 449 aa  70.5  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  42.31 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.31 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.31 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  42.31 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  34.43 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  35.34 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  34.17 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  36.27 
 
 		 416 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 397 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  31.39 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 		 420 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  33.33 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 		 399 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 		 391 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  33.58 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  32.06 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  36.54 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  39.45 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  40.59 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  30.61 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  35.34 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  31.43 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  30.66 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  30.66 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  30.66 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  29.93 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  30.15 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  30.15 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  34.21 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  31.5 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 		 410 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  37.17 
 
 		 376 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  32.76 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>