143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0328 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0328  HPP family protein+B94  100 
 
 		 134 aa  266  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00996185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  77.87 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  51.52 
 
 		 376 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  44.44 
 
 		 378 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  47.47 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  51.65 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  48.42 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  41.46 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  42.27 
 
 		 391 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 399 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  42.27 
 
 		 391 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 391 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  45.26 
 
 		 379 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  45.36 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  43.3 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  42.42 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  42.11 
 
 		 416 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  56.25 
 
 		 374 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  44.9 
 
 		 373 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  42.11 
 
 		 382 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 465 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 382 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 397 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  42.11 
 
 		 397 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 397 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  42.42 
 
 		 382 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  44.21 
 
 		 379 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  44.21 
 
 		 379 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 		 376 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  45.36 
 
 		 361 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  40.68 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  41.24 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  41.24 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  37.4 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  47.22 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  41.49 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  43.68 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  48.89 
 
 		 410 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  50.63 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  51.47 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  40.95 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  41.05 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  37.37 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  39.78 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  36.36 
 
 		 404 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  38.68 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 344 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  37.37 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  39.22 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  39.22 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  39.22 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  39.22 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  39.22 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  38.68 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  38.68 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 449 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  36.79 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  39.82 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  36.79 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  37.86 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  37.86 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  35.85 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  39.58 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  31.36 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  38.64 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  42.67 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  33.93 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  42.5 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  32.98 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  45.35 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  39.42 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.07 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  35.92 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  46.97 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  37.5 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.19 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  36.19 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  36.67 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  52.54 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  32.48 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  35.92 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  32.48 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  35.71 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  43.62 
 
 		 385 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  35.79 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  48.44 
 
 		 366 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  36.61 
 
 		 420 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  42.53 
 
 		 376 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  37.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  45.65 
 
 		 377 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  50 
 
 		 385 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  40 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>