More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3698 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  42.58 
 
 
399 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
391 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
391 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
391 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  37.75 
 
 
373 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  36 
 
 
390 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  38.31 
 
 
391 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  37.34 
 
 
378 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
391 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
391 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  36.21 
 
 
416 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  35.4 
 
 
382 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  35.4 
 
 
382 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 
401 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  37.11 
 
 
388 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
383 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
397 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
397 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  34.48 
 
 
397 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  34.48 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  35.22 
 
 
346 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  32.97 
 
 
465 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 
374 aa  84.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  27.61 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  28.24 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  34.24 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 
392 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  32.1 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.21 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 
376 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  28.92 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  32.28 
 
 
385 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  30.86 
 
 
404 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  32.05 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.32 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.61 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  29.34 
 
 
389 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  33.58 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
142 aa  61.6  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
384 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
384 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
225 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 
384 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
162 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 
361 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  30.13 
 
 
688 aa  58.2  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  30.25 
 
 
339 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.17 
 
 
339 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  33.33 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.06 
 
 
132 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.71 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.33 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 
688 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.4 
 
 
426 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  28.1 
 
 
383 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
149 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.34 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  32.72 
 
 
379 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  30.88 
 
 
144 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.83 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.2 
 
 
152 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
385 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
379 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  33.13 
 
 
379 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 
141 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.66 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.66 
 
 
601 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.61 
 
 
427 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.07 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  29.19 
 
 
373 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>