More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1789 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 385 aa  757    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  89.35 
 
 		 384 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  89.61 
 
 		 384 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  90.91 
 
 		 384 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  42.37 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  42.63 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  40.67 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 410 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  39.95 
 
 		 392 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  38.94 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  36.51 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  36.79 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 376 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  36.53 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  36.53 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 465 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  37.27 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  37.27 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  33.69 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  34.16 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  36.83 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  34.07 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  32.7 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  33.96 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  32.7 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  34.89 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  35.28 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.83 
 
 		 361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  37.03 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  38.44 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  36.77 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  35.6 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  34.94 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  36.77 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  36.12 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  34.9 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.85 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  43.97 
 
 		 231 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  34.84 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  34.99 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  34.5 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  33.43 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  33.88 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  32.69 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  31.32 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  37.75 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  32.02 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  34.44 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  29.27 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.47 
 
 		 238 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  39.34 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  34.5 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  35.68 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  33.01 
 
 		 240 aa  96.3  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  30.77 
 
 		 324 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  28.96 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  35.46 
 
 		 231 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  34.44 
 
 		 284 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  35.85 
 
 		 231 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  35.03 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  40 
 
 		 216 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 		 199 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  41.03 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  36.25 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.63 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  33.91 
 
 		 184 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  33.04 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.29 
 
 		 862 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  33.04 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  35.06 
 
 		 863 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  37.59 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  34.87 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.05 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  32.17 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  32.17 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  34.23 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>