More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1632 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  407  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  53.08 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  46.82 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  47.37 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  51.88 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  51.25 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  34.41 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.64 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.8 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.13 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  33.85 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.94 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.37 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  24.44 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.58 
 
 		 426 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 147 aa  62  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.21 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.07 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.94 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  34.81 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  35.43 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.72 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.67 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  27.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.47 
 
 		 845 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.23 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  30.82 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.17 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  47.17 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  30.2 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  30.2 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  29.14 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  27.81 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.06 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  26.77 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.39 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.47 
 
 		 513 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  24.81 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.72 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.94 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  29.14 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.32 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.47 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.38 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  29.53 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  23.65 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  34.13 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  27.82 
 
 		 890 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  28.36 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 391 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  24.62 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  23.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.25 
 
 		 500 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  29.45 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  25.93 
 
 		 513 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.59 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.15 
 
 		 384 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>