More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1907 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  68.53 
 
 		 226 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  68.53 
 
 		 226 aa  291  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  67.67 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  53.94 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  30.14 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 385 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.72 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  29.27 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 		 368 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  34.35 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.2 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.72 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.67 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.2 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.65 
 
 		 845 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.27 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  32.56 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.33 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  24.32 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.33 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.89 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.88 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  30.56 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.5 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.41 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  29.86 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32.45 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  30.94 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.59 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  25.37 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.14 
 
 		 769 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.28 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  24.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.12 
 
 		 873 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.33 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.78 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  27.69 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  26.8 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  27.46 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  27.07 
 
 		 416 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.61 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  28.68 
 
 		 880 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  23.88 
 
 		 513 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  32.03 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  31.51 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.15 
 
 		 903 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.91 
 
 		 909 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  23.19 
 
 		 513 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>