More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0381 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 688 aa  929    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 688 aa  1368    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  84.35 
 
 		 689 aa  1127    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  67.78 
 
 		 688 aa  910    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  37.25 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 468 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 422 aa  228  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 487 aa  227  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  35.91 
 
 		 468 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  34.56 
 
 		 468 aa  220  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  38.63 
 
 		 552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 552 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 552 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  36 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  36 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 552 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  36 
 
 		 436 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  37.93 
 
 		 564 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  37.38 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  37.38 
 
 		 552 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 552 aa  210  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 563 aa  210  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 436 aa  210  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  32.81 
 
 		 446 aa  210  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  38.44 
 
 		 553 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  36.79 
 
 		 552 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 565 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  36.68 
 
 		 564 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 554 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  35.91 
 
 		 560 aa  207  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  37.37 
 
 		 574 aa  207  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  33.65 
 
 		 432 aa  206  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  35.42 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  35.26 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  37.54 
 
 		 539 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  37.01 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 527 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  37.01 
 
 		 539 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 511 aa  203  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  36.84 
 
 		 558 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  36.12 
 
 		 539 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.91 
 
 		 444 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 565 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  36.48 
 
 		 557 aa  203  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 567 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  36.42 
 
 		 539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 567 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 525 aa  201  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  35.83 
 
 		 563 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  35.26 
 
 		 567 aa  200  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  32.27 
 
 		 493 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  32.92 
 
 		 496 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 514 aa  200  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  37.9 
 
 		 554 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  33.01 
 
 		 496 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  35.67 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  32.76 
 
 		 527 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.58 
 
 		 433 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  37.66 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 495 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  32.27 
 
 		 491 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 541 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  33 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  34.09 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  34.09 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  34.75 
 
 		 438 aa  196  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  36.58 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  32.75 
 
 		 552 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0329  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.1 
 
 		 442 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000181979  normal  0.0690464 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 426 aa  195  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  34.87 
 
 		 430 aa  195  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  33.25 
 
 		 489 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 558 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  36.68 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  39.02 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  33.83 
 
 		 489 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  36.56 
 
 		 632 aa  194  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>