More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1695 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  100 
 
 
281 aa  564  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  85.61 
 
 
280 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  85.97 
 
 
280 aa  501  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  83.57 
 
 
282 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.32 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
279 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.66 
 
 
279 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.83 
 
 
320 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.46 
 
 
313 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  25.64 
 
 
315 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 
315 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.46 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.1 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  38.17 
 
 
166 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.92 
 
 
427 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.88 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.88 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.88 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  23.36 
 
 
423 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  25 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.64 
 
 
769 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.03 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.45 
 
 
503 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
688 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.27 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  26.87 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25.47 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.17 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  32 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.12 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  22.89 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31 
 
 
688 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.75 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  28.81 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  29.51 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  28.77 
 
 
646 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  25.24 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.72 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  32.54 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.31 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.53 
 
 
211 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.73 
 
 
513 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  28.69 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.57 
 
 
513 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.33 
 
 
152 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.31 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  30.34 
 
 
147 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.11 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.17 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.07 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
144 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
698 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.82 
 
 
142 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  28.99 
 
 
683 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.53 
 
 
399 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.4 
 
 
147 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.71 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  31.25 
 
 
154 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43920  5'-AMP-activated protein kinase, gamma subunit  27.8 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.85 
 
 
504 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.91 
 
 
150 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.35 
 
 
219 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
131 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44512  predicted protein  23.62 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  27.69 
 
 
368 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  31.65 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.43 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  24.14 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  31.65 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.99 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.67 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  29.51 
 
 
696 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>