81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43920 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43920  5'-AMP-activated protein kinase, gamma subunit  100 
 
 
338 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307188 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10854  Snf1 protein kinase complex subunit Snf4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12990)  57.23 
 
 
431 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.492106  normal  0.165725 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03430  hypothetical protein  44.38 
 
 
438 aa  292  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44512  predicted protein  27.69 
 
 
340 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  24.23 
 
 
482 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.8 
 
 
281 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.94 
 
 
426 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.02 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.57 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  24.31 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.54 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
143 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  24.88 
 
 
282 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
143 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  27.05 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  27.92 
 
 
433 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  23.19 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  27.8 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  27.54 
 
 
153 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  27.54 
 
 
153 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.8 
 
 
427 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  25.74 
 
 
436 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.26 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.3 
 
 
143 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24310  predicted protein  27.1 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.17 
 
 
427 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  24 
 
 
144 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.57 
 
 
154 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  26.71 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  24.44 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 
223 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.78 
 
 
489 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.89 
 
 
495 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  25.69 
 
 
503 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.06 
 
 
489 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.32 
 
 
490 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
215 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  23.08 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  27.4 
 
 
656 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  26.71 
 
 
655 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  30.88 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.86 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.62 
 
 
491 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.48 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  27.83 
 
 
136 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
149 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  22.76 
 
 
488 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.66 
 
 
230 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  22.06 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.15 
 
 
517 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  26.71 
 
 
660 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  26.95 
 
 
157 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.08 
 
 
161 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  23.77 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.05 
 
 
488 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
431 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  28.45 
 
 
133 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  21.43 
 
 
377 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  21.8 
 
 
152 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.21 
 
 
153 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  24.11 
 
 
177 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.73 
 
 
489 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 
149 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 
196 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  27.35 
 
 
144 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  27.64 
 
 
138 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  25.19 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  24.31 
 
 
423 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  21.66 
 
 
313 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.39 
 
 
503 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  24.41 
 
 
502 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  30.11 
 
 
142 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.96 
 
 
491 aa  42.7  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  25.4 
 
 
485 aa  42.7  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.85 
 
 
675 aa  42.4  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.29 
 
 
492 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.19 
 
 
486 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>