More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1393 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  100 
 
 		 136 aa  266  8e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  52.21 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  52.94 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  43.18 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  42.97 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  42.42 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  44.07 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  40.31 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  42.52 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  45.76 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  40.32 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  41.41 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  38.93 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  43.75 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  42.74 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  39.66 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  40.83 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  41.03 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  40.52 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  43.36 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.97 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  37.78 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  38.35 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  44.12 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  39.02 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  37.96 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  38.69 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 188 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  40.19 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  42.31 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  37.27 
 
 		 532 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.45 
 
 		 490 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.45 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.59 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  45.19 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  38.06 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  40.34 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  41 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.93 
 
 		 482 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  40.95 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.93 
 
 		 482 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 		 500 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  38.98 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  38.81 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  38.79 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  40.78 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  40.78 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.58 
 
 		 494 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  32.03 
 
 		 145 aa  66.6  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  39.52 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  36 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  37.72 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.18 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.94 
 
 		 501 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 574 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  38.6 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  40.37 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  32.84 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  32.43 
 
 		 490 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 486 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.45 
 
 		 485 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 643 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  29.51 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.67 
 
 		 499 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  39.47 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.82 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>