More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1474 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  100 
 
 		 128 aa  259  6e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  65.25 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  44.26 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  40.98 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  40 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.19 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.29 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.97 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  40 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.21 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  31.93 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 603 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  39.02 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.34 
 
 		 603 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 624 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.34 
 
 		 603 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  36.3 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.59 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.5 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  30.65 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.59 
 
 		 1560 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  40.91 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.81 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33.62 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  37.1 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.83 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  30.25 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.15 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  39.66 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  32 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  28.57 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.17 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  34.17 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.51 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  34.34 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  32.5 
 
 		 513 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 		 498 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  35.54 
 
 		 907 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.68 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  33.94 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>