More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0305 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  100 
 
 
185 aa  366  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  41.76 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  37.77 
 
 
217 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  42.86 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  39.23 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  37.36 
 
 
188 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  39.56 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  38.71 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  37.63 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  35.9 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.97 
 
 
207 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  37.1 
 
 
186 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  43.09 
 
 
165 aa  99  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.12 
 
 
140 aa  89  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
149 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  40.17 
 
 
148 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
149 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
149 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
149 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  46.15 
 
 
120 aa  88.2  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0668  putative signal transduction protein with CBS domains  29.57 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
149 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  41.88 
 
 
480 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
291 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
149 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  28.14 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  36.75 
 
 
140 aa  85.5  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  27.57 
 
 
212 aa  85.1  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.17 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  37.01 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.22 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  28.37 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  32.34 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  32.16 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  32.34 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  38.1 
 
 
141 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  36.59 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  37.7 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.11 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.56 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  38.52 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  33.92 
 
 
281 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
150 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
141 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  35.66 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.93 
 
 
145 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  32.4 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  32.74 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.97 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  36.92 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  39.67 
 
 
606 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  34.97 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.76 
 
 
605 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.81 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  39.67 
 
 
606 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  34.55 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.33 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  35.14 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.34 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  37.61 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  31.25 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  40.5 
 
 
606 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  37.23 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  34.75 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35.65 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  35.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.51 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
688 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.84 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  35.34 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  38.18 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  36.97 
 
 
865 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  40.21 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  37.07 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  34.15 
 
 
586 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  34.19 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.88 
 
 
589 aa  72  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.6 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>