More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5408 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  51.39 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  53.79 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  57.14 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  50.69 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  49.66 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  50.68 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  50.68 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  50.68 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  48.28 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  47.92 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  49.32 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  49.3 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  55.46 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  47.59 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  48.28 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  47.62 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  46.94 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  46.94 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  46.94 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  47.59 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  45.52 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  48.57 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  45.27 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.59 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  42.76 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.37 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  45.89 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  45.58 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  44.22 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  45.21 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  46.94 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  43.15 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  44.14 
 
 		 153 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  45.52 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  43.75 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  40.97 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  41.1 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  39.73 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  41.43 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  41.84 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  40.3 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  43.26 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  39.57 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  37.67 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  45.53 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  37.32 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.21 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  47.47 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  38.62 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  41.55 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.97 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  37.68 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  44.44 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  40.94 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  45.16 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 177 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  37.32 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  39.06 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  37.06 
 
 		 174 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  34.51 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.65 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  33.57 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  37.59 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  39.71 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2047  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>