More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4477 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  100 
 
 		 145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  59.72 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  60.42 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  60.42 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  60.42 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  61.11 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  52.41 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  47.89 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  47.55 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  47.83 
 
 		 177 aa  120  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  47.18 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  46.15 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  45.07 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  42.96 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  44.44 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  43.66 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  43.75 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.66 
 
 		 143 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  43.48 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  43.66 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  46.48 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  46.48 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  42.65 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  44.06 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  42.25 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  43.66 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  41.26 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  39.44 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  36.62 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  42.75 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  39.86 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  39.57 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  43.45 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  41.55 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  39.86 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  39.44 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  36.81 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  40 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  39.72 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  35.42 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  40.14 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  39.01 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  37.67 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  40.62 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  38.58 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  44 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.14 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  36.81 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  39.69 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.24 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  38.93 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  32.65 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  38.93 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.84 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  40.19 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.97 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  31.69 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  37.96 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  36.81 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.65 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  34.72 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  34.67 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  39.34 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  40.71 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36.23 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  30.14 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  34.15 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  34.97 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  37.24 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3577  signal-transduction protein  46.05 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3517  signal-transduction protein  46.05 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>