More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2870 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2870  CBS  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  37.86 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  43.57 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  39.26 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  36.72 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  36.43 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  37.19 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  44.04 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  34.85 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  37.72 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  41.94 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  35.78 
 
 		 613 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 		 609 aa  74.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  34.03 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 		 615 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  32.58 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  40 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.53 
 
 		 614 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  37.62 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 618 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 611 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  33.04 
 
 		 666 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  28.99 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32.11 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  28.87 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  39.39 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 704 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  34.34 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  33.66 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.66 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.66 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  31.9 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  39.39 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 620 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  32.8 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  29.01 
 
 		 443 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  33.66 
 
 		 615 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.04 
 
 		 688 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 620 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 615 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  33.87 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  26.92 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>