More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0253 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  100 
 
 
140 aa  275  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  75.36 
 
 
139 aa  225  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  52.21 
 
 
136 aa  148  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  50.77 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  45.04 
 
 
139 aa  117  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  45.86 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  45.11 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  47.41 
 
 
142 aa  111  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  47.41 
 
 
135 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  38.64 
 
 
139 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  43.22 
 
 
143 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  47.41 
 
 
132 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  40.46 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  44.07 
 
 
126 aa  100  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  39.23 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  41.67 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  41.48 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.4 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  39.84 
 
 
138 aa  94  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  42.28 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  37.4 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  42.06 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  39.69 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  38.84 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  42.11 
 
 
688 aa  85.9  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  39.85 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  41.23 
 
 
688 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  43.1 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  35.2 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  41.09 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  38.81 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.54 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
688 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.69 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  39.84 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  35.83 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  35.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  41.96 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  35.04 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  34.23 
 
 
646 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.4 
 
 
648 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  33.59 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  36 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 
643 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  39.52 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  38.21 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.15 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  36 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.13 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  42.71 
 
 
689 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.4 
 
 
485 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  32.48 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
645 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 
638 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.05 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  38.05 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.71 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  34.51 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
663 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.4 
 
 
664 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.54 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  27.54 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
625 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.76 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  33.04 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.36 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  34.51 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  28.93 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 
644 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  31.53 
 
 
644 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  34.51 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  32.41 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  35.19 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
484 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 
625 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  25.98 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35.71 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  41.56 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  35.96 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  31.71 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.19 
 
 
574 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  32.43 
 
 
646 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.83 
 
 
498 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
196 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  30.63 
 
 
622 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>