More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3542 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
140 aa  291  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  43.85 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  39.13 
 
 
148 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  34.04 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  35.71 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  30.71 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  39.81 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  39.81 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.14 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.46 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  40.91 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  40.95 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
704 aa  67  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  41 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  35 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 
645 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  37.38 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  30.65 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.23 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  39.6 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  35.45 
 
 
606 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  35.45 
 
 
606 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  30.16 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.45 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  35.25 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  33.33 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.71 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  36.19 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
638 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.83 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  41.84 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  37.37 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.56 
 
 
188 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  35.24 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  39.05 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  31.03 
 
 
174 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.74 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
645 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  32.58 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
645 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.04 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
645 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  34.78 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  35.71 
 
 
331 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  33.01 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
606 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  34.65 
 
 
666 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.98 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.03 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.01 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  30.09 
 
 
644 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
609 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35.45 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.29 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 
643 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  40 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  32.76 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 
615 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  29.55 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  31.78 
 
 
646 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
688 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  28.8 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  30.58 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  34.31 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 
645 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
603 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  34.75 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  32.11 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 
603 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.73 
 
 
688 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
645 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.45 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>