More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3128 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  69.72 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  66.9 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  67.13 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  65.49 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  67.61 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  61.27 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  47.48 
 
 		 177 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  46.85 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.85 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  50 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  50 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  46.85 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  46.85 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  50.68 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  46.15 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  43.88 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  43.36 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  44.68 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  43.36 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  42.14 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  43.57 
 
 		 142 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  43.57 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  42.45 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  42.66 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  41.73 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  42.96 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  45 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  39.01 
 
 		 141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  42.45 
 
 		 174 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  42.45 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  42.96 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  43.88 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  43.57 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  43.66 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  40.56 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  43.57 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  41.84 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.86 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  36.69 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  40.29 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  38.57 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  38.57 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  40.58 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  38.85 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  35 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  38.41 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  38.73 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  40.28 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  34.29 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.68 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  35.21 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.68 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  36.88 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3517  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3505  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3577  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  35.97 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  39.71 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  34.06 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  36.62 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>