More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29166 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1254    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  46.38 
 
 
666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  38.24 
 
 
704 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  30.29 
 
 
443 aa  179  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  32.09 
 
 
146 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  33.05 
 
 
146 aa  77  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  37.19 
 
 
145 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  39.18 
 
 
140 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  34.75 
 
 
148 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  36.08 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  33.83 
 
 
615 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
615 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
620 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
620 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.61 
 
 
125 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
620 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 
140 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  30 
 
 
140 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  32.78 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  30.92 
 
 
620 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  30.52 
 
 
615 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
155 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 
615 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  30.52 
 
 
615 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.52 
 
 
615 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
286 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
144 aa  63.9  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
615 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.09 
 
 
625 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 
641 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  34 
 
 
143 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 
140 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  32.58 
 
 
139 aa  60.8  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.51 
 
 
613 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3086  cyclic nucleotide-binding protein  34.09 
 
 
615 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.238532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  29.17 
 
 
138 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
625 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.52 
 
 
152 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  26.77 
 
 
144 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  34.74 
 
 
613 aa  58.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  30.77 
 
 
142 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2465  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2510  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
618 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  35 
 
 
323 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  38.27 
 
 
131 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 
146 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  28.06 
 
 
139 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  24.41 
 
 
144 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
615 aa  57  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
140 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  32.69 
 
 
332 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  31.31 
 
 
170 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26 
 
 
315 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  26.09 
 
 
144 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.82 
 
 
503 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  27.5 
 
 
139 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  31.07 
 
 
153 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  21.09 
 
 
143 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 
153 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  20.31 
 
 
143 aa  55.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
618 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.64 
 
 
626 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 
145 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.09 
 
 
262 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  32.03 
 
 
601 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.99 
 
 
153 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.33 
 
 
147 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  41.33 
 
 
135 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32 
 
 
153 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32 
 
 
153 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  28.87 
 
 
120 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  31.96 
 
 
153 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  24.6 
 
 
145 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  28.28 
 
 
174 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  31.96 
 
 
153 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30 
 
 
139 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  29.57 
 
 
144 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  26.92 
 
 
164 aa  54.7  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.14 
 
 
606 aa  54.7  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  30.48 
 
 
622 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
529 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 
638 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  34.41 
 
 
614 aa  53.9  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  32.63 
 
 
136 aa  53.9  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  29.57 
 
 
146 aa  53.9  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.83 
 
 
145 aa  53.9  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.7 
 
 
145 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.31 
 
 
1122 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
142 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>