More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2115 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
148 aa  290  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  68.64 
 
 
131 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  57.98 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  37.19 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  35.46 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  33.64 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  39.83 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  37.29 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  39.45 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  41.12 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  40.35 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  37.41 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  36.67 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.36 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  31.97 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.11 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  33.33 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
618 aa  67  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  35.14 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  41 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  35.83 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  38.04 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  32.76 
 
 
615 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  35.14 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.25 
 
 
614 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  41.07 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.55 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  38.39 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  33.9 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  34.75 
 
 
443 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  31.36 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  33.64 
 
 
666 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  30 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.46 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32.43 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32.43 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
625 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
624 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
615 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.43 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  33.9 
 
 
606 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  47.13 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  33.9 
 
 
606 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  37.36 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  36.36 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
624 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.19 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  33.9 
 
 
186 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 
286 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.63 
 
 
903 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  30.91 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  38.78 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  28.1 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  31.5 
 
 
236 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.03 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.27 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.14 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  31.25 
 
 
242 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  32 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  39.33 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.36 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  30 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  33.05 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  33.64 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.26 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.17 
 
 
615 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  34.78 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  35.16 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
606 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  30.84 
 
 
613 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
615 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.19 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  36.36 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  32.38 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.86 
 
 
185 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  40.66 
 
 
625 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.17 
 
 
615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  36.96 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 
615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.17 
 
 
615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  33.33 
 
 
626 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  35.48 
 
 
611 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>