More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1025 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  58.06 
 
 		 663 aa  749    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 645 aa  1322    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  51.2 
 
 		 625 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  50.24 
 
 		 622 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  50.16 
 
 		 644 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  50.08 
 
 		 643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  49.2 
 
 		 646 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  49.68 
 
 		 629 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  49.92 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  46.81 
 
 		 638 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  49.52 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  49.36 
 
 		 645 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  49.52 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  48.72 
 
 		 645 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  46.72 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  43.96 
 
 		 646 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  47.76 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  39.31 
 
 		 646 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  47.52 
 
 		 481 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  34.07 
 
 		 644 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  31.39 
 
 		 624 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 618 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.78 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  30.13 
 
 		 626 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.94 
 
 		 660 aa  299  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  29.36 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.78 
 
 		 615 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.99 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 		 615 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  28.01 
 
 		 628 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.4 
 
 		 629 aa  290  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 		 639 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.82 
 
 		 613 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  28.73 
 
 		 625 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  32.48 
 
 		 606 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 		 615 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 		 615 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 606 aa  283  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  28.77 
 
 		 626 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.32 
 
 		 615 aa  283  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 649 aa  282  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 667 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 		 603 aa  280  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 624 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 625 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  30.18 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  30.89 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 		 620 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.32 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.32 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.74 
 
 		 649 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.32 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 629 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  29.06 
 
 		 637 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  30.35 
 
 		 620 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 615 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  27.23 
 
 		 641 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  30.55 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  27.79 
 
 		 626 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  27.53 
 
 		 627 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  29.72 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  29.72 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.43 
 
 		 615 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.21 
 
 		 642 aa  266  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.19 
 
 		 606 aa  264  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 641 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.56 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.56 
 
 		 605 aa  257  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  30.38 
 
 		 603 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.4 
 
 		 601 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.25 
 
 		 603 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.25 
 
 		 603 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 		 639 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.76 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 603 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  27.22 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  32.01 
 
 		 603 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  31.22 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  26.03 
 
 		 622 aa  244  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 641 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  30.31 
 
 		 634 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  39.65 
 
 		 351 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 615 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.08 
 
 		 648 aa  225  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.12 
 
 		 596 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.02 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 		 485 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.6 
 
 		 600 aa  208  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.53 
 
 		 636 aa  208  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30.62 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 604 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.03 
 
 		 596 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>