More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0269 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  67.78 
 
 		 688 aa  934    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  67.21 
 
 		 689 aa  894    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  97.67 
 
 		 688 aa  1318    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  100 
 
 		 688 aa  1373    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  39.45 
 
 		 442 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 487 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  36.52 
 
 		 432 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  36.52 
 
 		 468 aa  233  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  36.52 
 
 		 468 aa  233  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  39.38 
 
 		 552 aa  223  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 552 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  40.87 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  39.38 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  42.95 
 
 		 539 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  39.94 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  41.1 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  41.1 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  41.1 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  41.42 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  39.63 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 422 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 563 aa  217  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  38.15 
 
 		 552 aa  216  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  37.85 
 
 		 560 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  39.4 
 
 		 563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 511 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  36.25 
 
 		 574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  38.83 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  34.56 
 
 		 446 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 527 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 552 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 552 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  37.5 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  38.12 
 
 		 564 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 498 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 567 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  37.19 
 
 		 557 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  40.13 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 567 aa  211  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  37.74 
 
 		 567 aa  210  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  37.86 
 
 		 553 aa  210  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  37.85 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  39.87 
 
 		 525 aa  208  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  38.82 
 
 		 556 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  39.35 
 
 		 556 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  39.48 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 539 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  38.82 
 
 		 539 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0265  general substrate transporter  35.31 
 
 		 421 aa  207  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.931457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  38.51 
 
 		 539 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  33.94 
 
 		 439 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  37.27 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  37.89 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 437 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  40.73 
 
 		 525 aa  203  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6117  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 552 aa  203  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154468  normal  0.620567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 563 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  36.68 
 
 		 632 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 437 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  38.56 
 
 		 549 aa  200  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  39.48 
 
 		 554 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  36.68 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  35.7 
 
 		 554 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 558 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  37.3 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  37.77 
 
 		 540 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6133  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376404  normal  0.0270764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 556 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  39.29 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3981  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 436 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 436 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  33.07 
 
 		 440 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 436 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  33.07 
 
 		 440 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.67 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  33.33 
 
 		 440 aa  195  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  33.33 
 
 		 441 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 568 aa  194  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>