More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3744 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  100 
 
 		 148 aa  294  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  37.76 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  36.43 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  38.26 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  35.46 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  38.14 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  33.58 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  33.88 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  37.04 
 
 		 603 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  39.02 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  42.99 
 
 		 443 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  32.06 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  29.85 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  40.83 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  40.83 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.03 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.38 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  39.77 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.23 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  31.54 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  34.17 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  29.23 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32.59 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 		 606 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 625 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1679  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0332032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1750  putative signal transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0985787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.93 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  29.77 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.6 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.19 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 609 aa  68.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  40.59 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  31.06 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  26.92 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 624 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  35.65 
 
 		 666 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  29.01 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  32.58 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  33.85 
 
 		 704 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0857  CBS  29.01 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  28.03 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>