More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1523 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  78.91 
 
 		 154 aa  241  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  73.55 
 
 		 155 aa  240  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  75.51 
 
 		 151 aa  237  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  78.23 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  72.97 
 
 		 153 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  75.86 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2047  CBS domain containing protein  72.44 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  74.17 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  71.62 
 
 		 153 aa  228  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1657  XRE family transcriptional regulator  72.44 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  71.72 
 
 		 148 aa  227  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  72.6 
 
 		 151 aa  227  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  71.92 
 
 		 151 aa  226  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  69.33 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  71.92 
 
 		 151 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  69.08 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  70.06 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  70.7 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 151 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  68.39 
 
 		 151 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 151 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 151 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 151 aa  213  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  71.33 
 
 		 151 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 151 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  68 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  65.33 
 
 		 151 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0857  CBS  56.55 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  53.64 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1489  CBS  42.21 
 
 		 239 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  33.58 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  32.86 
 
 		 142 aa  84  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  30.94 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.58 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  27.86 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  32.62 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  31.65 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  28.78 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  33.81 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.33 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  31.94 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  31.88 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  29.5 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  32.06 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  27.14 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  30 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  28.57 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  28.26 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  32.59 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>