More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3746 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  47.22 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  43.57 
 
 
146 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  42.14 
 
 
140 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  40 
 
 
613 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40.59 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  37.4 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  38.71 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  38.02 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  36.29 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  36.13 
 
 
615 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
625 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  35 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.71 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  32.79 
 
 
611 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  40.34 
 
 
623 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0019  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.07 
 
 
835 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
639 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  42.86 
 
 
613 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
618 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1432 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.84 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
609 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.43 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.93 
 
 
614 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  33.33 
 
 
443 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  33.63 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
618 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  36.63 
 
 
666 aa  61.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.06 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  32.11 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  32.38 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
1654 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  36.61 
 
 
286 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  32.09 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
767 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.61 
 
 
615 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 
615 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  31.93 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 
615 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
1428 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.65 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  30.88 
 
 
606 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 
606 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.78 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32.08 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
704 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  32.71 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.91 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  32.12 
 
 
606 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 
480 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 
615 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 
620 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  32.77 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.89 
 
 
413 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  28.97 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  28.83 
 
 
648 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
620 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
620 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
620 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.71 
 
 
605 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
606 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  28.06 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  29.66 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.63 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  29.92 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  31.82 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  30.89 
 
 
413 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  26.61 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  37.21 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 
615 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.84 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  28.97 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  32.38 
 
 
622 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  30.33 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
500 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3019  signal-transduction protein  38.75 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  26.57 
 
 
188 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.83 
 
 
837 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0819  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
500 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  28.36 
 
 
627 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  33.64 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.31 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 
624 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  27.78 
 
 
626 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.14 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  34.95 
 
 
380 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  26.77 
 
 
625 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>