More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1515 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  90.97 
 
 		 615 aa  1177    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  95 
 
 		 620 aa  1228    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  91.29 
 
 		 615 aa  1182    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  91.13 
 
 		 615 aa  1178    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  75.97 
 
 		 615 aa  994    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  90.81 
 
 		 615 aa  1174    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  90.97 
 
 		 615 aa  1177    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 620 aa  1280    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 620 aa  1280    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  77.42 
 
 		 615 aa  1004    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  76.77 
 
 		 615 aa  1004    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  77.42 
 
 		 615 aa  1006    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  73.71 
 
 		 615 aa  967    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  97.9 
 
 		 620 aa  1255    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  74.52 
 
 		 618 aa  975    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  60.16 
 
 		 614 aa  762    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 625 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  39.52 
 
 		 624 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  37.92 
 
 		 637 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 629 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  35.77 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  35.4 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  35.18 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  35.78 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  34.39 
 
 		 624 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  34.66 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 625 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.28 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  34.41 
 
 		 627 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  34.82 
 
 		 628 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  35.53 
 
 		 606 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  35.39 
 
 		 639 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  35.69 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  33.71 
 
 		 641 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 		 606 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.78 
 
 		 613 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  35.74 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 606 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  32.69 
 
 		 625 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  32.8 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  36.54 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  33.65 
 
 		 633 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.86 
 
 		 605 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 603 aa  363  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  31.57 
 
 		 648 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  34.31 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.8 
 
 		 644 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.38 
 
 		 606 aa  329  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.64 
 
 		 637 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  29.98 
 
 		 622 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  34.2 
 
 		 615 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  30.45 
 
 		 646 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.87 
 
 		 642 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 667 aa  290  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.62 
 
 		 649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.44 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.14 
 
 		 650 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.28 
 
 		 601 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  31.42 
 
 		 603 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.46 
 
 		 660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  29.68 
 
 		 629 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  29.72 
 
 		 645 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  32.86 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  28.93 
 
 		 638 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 		 639 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 603 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.98 
 
 		 603 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.14 
 
 		 603 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 596 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.05 
 
 		 625 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  28.17 
 
 		 663 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  27.46 
 
 		 646 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28 
 
 		 648 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 		 603 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 645 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  27.3 
 
 		 645 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 645 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.99 
 
 		 649 aa  251  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.25 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 645 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  27.27 
 
 		 644 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 601 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 		 634 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  26.63 
 
 		 643 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  27.32 
 
 		 622 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  31.14 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  30.02 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 613 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30.7 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.06 
 
 		 478 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.47 
 
 		 633 aa  223  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 600 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  28.31 
 
 		 608 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  29.18 
 
 		 598 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>