More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1034 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  70.31 
 
 
649 aa  965    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  68.62 
 
 
649 aa  931    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  76.77 
 
 
650 aa  1056    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  100 
 
 
660 aa  1370    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  36.12 
 
 
639 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  34.53 
 
 
644 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.08 
 
 
637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  29.94 
 
 
645 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 
624 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  30.85 
 
 
629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.98 
 
 
613 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  30.8 
 
 
615 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
618 aa  281  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.5 
 
 
636 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  29.16 
 
 
623 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  30.46 
 
 
620 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  30.46 
 
 
620 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.98 
 
 
620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 
625 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
620 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.84 
 
 
667 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 
623 aa  273  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.9 
 
 
642 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  29.95 
 
 
615 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  28.5 
 
 
644 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 
606 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  29.19 
 
 
606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
618 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
615 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.58 
 
 
615 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 
634 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.53 
 
 
615 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.58 
 
 
615 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.42 
 
 
615 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  30.03 
 
 
629 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  28.62 
 
 
646 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.81 
 
 
648 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  28.19 
 
 
622 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.95 
 
 
629 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.28 
 
 
633 aa  262  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
606 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
645 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
615 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  33.26 
 
 
486 aa  261  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  28.84 
 
 
625 aa  261  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
615 aa  260  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
643 aa  259  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  27.95 
 
 
633 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  28.48 
 
 
648 aa  259  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  27.54 
 
 
641 aa  259  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  29.83 
 
 
628 aa  259  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.61 
 
 
614 aa  259  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.6 
 
 
627 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 
615 aa  257  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  28.19 
 
 
626 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  28 
 
 
624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  28.42 
 
 
606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  28.62 
 
 
626 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 
645 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
629 aa  253  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  27.91 
 
 
641 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
645 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  27.55 
 
 
641 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
645 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  28.72 
 
 
645 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  25.9 
 
 
646 aa  250  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.79 
 
 
626 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.89 
 
 
637 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  27.31 
 
 
638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  30.31 
 
 
663 aa  240  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.93 
 
 
635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  26.19 
 
 
601 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  30.71 
 
 
481 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.06 
 
 
606 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
625 aa  231  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.83 
 
 
605 aa  228  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.3 
 
 
603 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.03 
 
 
603 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  26.06 
 
 
622 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.73 
 
 
603 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 
603 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.4 
 
 
601 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.4 
 
 
601 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  26.74 
 
 
603 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.28 
 
 
625 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.84 
 
 
603 aa  218  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.82 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  29.83 
 
 
480 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  25.76 
 
 
646 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  26.93 
 
 
599 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  25.31 
 
 
615 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.67 
 
 
596 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.84 
 
 
600 aa  196  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  26.37 
 
 
599 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 
601 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.09 
 
 
485 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.39 
 
 
478 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>