More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1022 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 613 aa  1226    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  41.11 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 600 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  35.65 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  33.39 
 
 		 574 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.9 
 
 		 637 aa  257  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.5 
 
 		 642 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 625 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.22 
 
 		 478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 		 615 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 618 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  27.99 
 
 		 620 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  28.08 
 
 		 615 aa  241  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 		 623 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 615 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.83 
 
 		 615 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 620 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 620 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 623 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  26.78 
 
 		 627 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  27.87 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  28.08 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.68 
 
 		 615 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.27 
 
 		 615 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.68 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.44 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  28.75 
 
 		 629 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.47 
 
 		 485 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 625 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  27.91 
 
 		 629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 639 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.07 
 
 		 644 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  27.71 
 
 		 633 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  28.92 
 
 		 626 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  28.13 
 
 		 624 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  27.36 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 		 615 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  29.54 
 
 		 615 aa  218  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.2 
 
 		 626 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.44 
 
 		 605 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  25.69 
 
 		 614 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.42 
 
 		 604 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 628 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.51 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  26.93 
 
 		 629 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.4 
 
 		 667 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.67 
 
 		 618 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.52 
 
 		 641 aa  209  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  27.68 
 
 		 608 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.04 
 
 		 637 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.08 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.44 
 
 		 625 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.99 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  26.14 
 
 		 622 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  27.72 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 604 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  27.64 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  28.14 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  24.48 
 
 		 624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  28.85 
 
 		 647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.44 
 
 		 606 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 643 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.93 
 
 		 649 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.3 
 
 		 629 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.32 
 
 		 648 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  29.52 
 
 		 681 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.32 
 
 		 603 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 641 aa  190  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  29.63 
 
 		 574 aa  190  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  27.3 
 
 		 607 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.32 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  29.49 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.71 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.78 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.55 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 615 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  30.52 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  32.19 
 
 		 599 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  25.43 
 
 		 610 aa  183  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.56 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  27.83 
 
 		 652 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 		 645 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.96 
 
 		 633 aa  180  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.33 
 
 		 650 aa  180  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 		 645 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.96 
 
 		 660 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.18 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  30.67 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  26.18 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  29.18 
 
 		 612 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  28.42 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 645 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>