208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2831 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  100 
 
 		 610 aa  1261    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  60.25 
 
 		 561 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  58.03 
 
 		 608 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  57.21 
 
 		 607 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  42.11 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  42.27 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.9 
 
 		 605 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 604 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.64 
 
 		 600 aa  365  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  33.44 
 
 		 601 aa  360  6e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.08 
 
 		 603 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 609 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.5 
 
 		 608 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.66 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 604 aa  326  6e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  31.35 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 608 aa  306  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 		 605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  31.88 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.2 
 
 		 603 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  28.79 
 
 		 647 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  34.59 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  27.58 
 
 		 681 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  28.68 
 
 		 652 aa  241  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.22 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  28.07 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  26.43 
 
 		 629 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.75 
 
 		 628 aa  223  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  26.31 
 
 		 629 aa  220  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25.77 
 
 		 629 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.6 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.45 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.05 
 
 		 626 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.43 
 
 		 644 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  26.12 
 
 		 601 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  25.16 
 
 		 633 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.32 
 
 		 624 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.82 
 
 		 478 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 618 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.83 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  24.8 
 
 		 629 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.08 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.08 
 
 		 638 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  23.57 
 
 		 626 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  24.35 
 
 		 625 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  28.84 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  23.79 
 
 		 641 aa  191  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  24.92 
 
 		 629 aa  183  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  25.43 
 
 		 613 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  25.36 
 
 		 646 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  25.04 
 
 		 645 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 615 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  24.88 
 
 		 644 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  23.54 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.72 
 
 		 625 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.55 
 
 		 627 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  25.77 
 
 		 618 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  24.92 
 
 		 646 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 		 663 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  24.76 
 
 		 622 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.48 
 
 		 622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  24.6 
 
 		 643 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.03 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.37 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  24.17 
 
 		 641 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.81 
 
 		 650 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  25.61 
 
 		 615 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  24.67 
 
 		 615 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.99 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  24.21 
 
 		 645 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.26 
 
 		 637 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  24.45 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.33 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  24.05 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 		 624 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.52 
 
 		 603 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.68 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.68 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.72 
 
 		 660 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  23.61 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.78 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 620 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 620 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.28 
 
 		 601 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 620 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.78 
 
 		 615 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  24.38 
 
 		 615 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.78 
 
 		 615 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.44 
 
 		 601 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  24.78 
 
 		 574 aa  164  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.61 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  24.53 
 
 		 620 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.74 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.11 
 
 		 485 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>