291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0392 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  100 
 
 
652 aa  1350    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  86.81 
 
 
647 aa  1175    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  55.28 
 
 
681 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  33.18 
 
 
612 aa  340  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  32.27 
 
 
608 aa  330  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 
617 aa  321  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.42 
 
 
608 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.96 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  35.77 
 
 
485 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.75 
 
 
603 aa  287  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  35.26 
 
 
565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.51 
 
 
603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.55 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  31.52 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.53 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  29.35 
 
 
607 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.64 
 
 
604 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.12 
 
 
601 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  31.06 
 
 
561 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  28.68 
 
 
610 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
605 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  29.92 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.42 
 
 
605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  29.47 
 
 
599 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  28.02 
 
 
615 aa  223  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.48 
 
 
604 aa  221  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.7 
 
 
637 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.83 
 
 
613 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.34 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  28.75 
 
 
480 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 
624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 
624 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  29.07 
 
 
633 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.16 
 
 
623 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 
639 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  30.8 
 
 
629 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.25 
 
 
637 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 
629 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.28 
 
 
629 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.28 
 
 
635 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.09 
 
 
613 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  28.29 
 
 
576 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.7 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26.38 
 
 
618 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  28.72 
 
 
625 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  28.27 
 
 
574 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.55 
 
 
644 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.54 
 
 
601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  26.02 
 
 
629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.05 
 
 
606 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  27.63 
 
 
486 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.24 
 
 
648 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.21 
 
 
626 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  26.66 
 
 
623 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  27.25 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.14 
 
 
650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  24.54 
 
 
648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.81 
 
 
625 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.66 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.29 
 
 
626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  27.15 
 
 
629 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.12 
 
 
667 aa  127  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  26.82 
 
 
626 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.73 
 
 
485 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  23.56 
 
 
622 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.25 
 
 
628 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  23.54 
 
 
622 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.52 
 
 
603 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
603 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  23.53 
 
 
644 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.71 
 
 
603 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
645 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.26 
 
 
649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.6 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  26.52 
 
 
627 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.29 
 
 
636 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.52 
 
 
596 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  24.59 
 
 
643 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 
615 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  24.46 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25 
 
 
615 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  23.16 
 
 
615 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.76 
 
 
641 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 
615 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25 
 
 
615 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.32 
 
 
625 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.76 
 
 
638 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  22.6 
 
 
645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  24.53 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  22.91 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  22.57 
 
 
645 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  24.89 
 
 
615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  24.89 
 
 
620 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  24.89 
 
 
620 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  24.68 
 
 
620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  23.98 
 
 
614 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  23.5 
 
 
646 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>