169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1193    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  94.16 
 
 
599 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  44.35 
 
 
608 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  44.26 
 
 
607 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  42.27 
 
 
610 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  43.97 
 
 
561 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.55 
 
 
605 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
609 aa  372  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.26 
 
 
603 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.4 
 
 
604 aa  352  8e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.07 
 
 
608 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  34.07 
 
 
601 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  38.59 
 
 
617 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  34.7 
 
 
608 aa  333  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.68 
 
 
608 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 
612 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  33.28 
 
 
615 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
600 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.93 
 
 
604 aa  319  7e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.11 
 
 
605 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  34.05 
 
 
605 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.09 
 
 
603 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  38.89 
 
 
485 aa  277  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  34.87 
 
 
565 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  28.92 
 
 
647 aa  248  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  28.7 
 
 
681 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  29.47 
 
 
652 aa  237  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  34 
 
 
478 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  29.18 
 
 
601 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.78 
 
 
606 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
623 aa  211  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  34.34 
 
 
480 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.7 
 
 
626 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.37 
 
 
660 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.46 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
623 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.71 
 
 
649 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  31.5 
 
 
574 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.65 
 
 
650 aa  191  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.52 
 
 
637 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  28.98 
 
 
606 aa  190  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.2 
 
 
626 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.8 
 
 
615 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25.08 
 
 
629 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.76 
 
 
625 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.92 
 
 
603 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.92 
 
 
603 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 
624 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.57 
 
 
633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  32.97 
 
 
613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.64 
 
 
603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  25.87 
 
 
629 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.64 
 
 
649 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.15 
 
 
615 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 
629 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.58 
 
 
625 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
624 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.75 
 
 
618 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.71 
 
 
642 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.75 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 
645 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  26.54 
 
 
620 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 
620 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 
620 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 
629 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.02 
 
 
615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.11 
 
 
615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 
615 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.02 
 
 
615 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.31 
 
 
637 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.02 
 
 
615 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  28.08 
 
 
629 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.14 
 
 
596 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 
620 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 
639 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 
615 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  24.83 
 
 
627 aa  171  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  27.55 
 
 
615 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  25.22 
 
 
628 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 
615 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 
603 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.92 
 
 
601 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 
606 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.76 
 
 
601 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  27.39 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
605 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.42 
 
 
641 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.04 
 
 
644 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.37 
 
 
635 aa  161  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.91 
 
 
596 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
634 aa  160  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.88 
 
 
605 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 
606 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.28 
 
 
626 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  28.83 
 
 
646 aa  156  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 
641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.83 
 
 
633 aa  153  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.07 
 
 
485 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  25.52 
 
 
646 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>