172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1892 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  94.16 
 
 		 599 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1191    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  44.75 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  44.19 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  42.11 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  43.79 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.9 
 
 		 605 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.39 
 
 		 604 aa  364  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.6 
 
 		 603 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  35.08 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  33.78 
 
 		 615 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 617 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 608 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.41 
 
 		 608 aa  330  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.98 
 
 		 604 aa  327  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 600 aa  327  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.49 
 
 		 605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 		 612 aa  326  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.7 
 
 		 608 aa  323  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 		 605 aa  317  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.44 
 
 		 603 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  39.12 
 
 		 485 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  35.37 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  30.31 
 
 		 681 aa  253  9.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 647 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  29.92 
 
 		 652 aa  238  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.92 
 
 		 478 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  35.01 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.93 
 
 		 660 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.89 
 
 		 606 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  28.2 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.88 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.39 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.41 
 
 		 649 aa  199  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  29.54 
 
 		 623 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.21 
 
 		 637 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.43 
 
 		 613 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  29.74 
 
 		 623 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.59 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.27 
 
 		 603 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  30.14 
 
 		 574 aa  184  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.04 
 
 		 626 aa  184  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 615 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  25.2 
 
 		 629 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.56 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 625 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  24.72 
 
 		 629 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.68 
 
 		 642 aa  180  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 		 615 aa  180  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  25.8 
 
 		 633 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.02 
 
 		 620 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 		 618 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.04 
 
 		 625 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 624 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.57 
 
 		 614 aa  177  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  28.25 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  24.67 
 
 		 624 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.35 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.35 
 
 		 615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 620 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 620 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 		 615 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.35 
 
 		 615 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 645 aa  174  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  26.75 
 
 		 615 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.3 
 
 		 627 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  25.97 
 
 		 629 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  25.16 
 
 		 637 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.65 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 596 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 618 aa  170  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.81 
 
 		 644 aa  170  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.47 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 		 629 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.2 
 
 		 641 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.27 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.24 
 
 		 606 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  27.08 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.11 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 603 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.54 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.12 
 
 		 596 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.78 
 
 		 606 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.27 
 
 		 626 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.8 
 
 		 635 aa  153  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  29.56 
 
 		 605 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.85 
 
 		 485 aa  151  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.21 
 
 		 633 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  23.76 
 
 		 641 aa  150  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>