184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0827 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  100 
 
 		 601 aa  1224    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.2 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.15 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 600 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  37.38 
 
 		 615 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  35.69 
 
 		 608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 605 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  35.19 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.06 
 
 		 603 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  35.75 
 
 		 617 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  34.72 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.78 
 
 		 608 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  33.44 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  32.67 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.44 
 
 		 608 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  34.64 
 
 		 561 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  34.63 
 
 		 599 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 605 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  33.62 
 
 		 599 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 605 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  35.61 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  34.03 
 
 		 485 aa  302  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 647 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 681 aa  257  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  29.12 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 613 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 		 623 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.19 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  28.34 
 
 		 624 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  28.62 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26 
 
 		 618 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  26.65 
 
 		 663 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.48 
 
 		 478 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 645 aa  203  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  25.16 
 
 		 629 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.36 
 
 		 637 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  25.36 
 
 		 637 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.82 
 
 		 624 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.22 
 
 		 606 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.73 
 
 		 603 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.9 
 
 		 603 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.27 
 
 		 628 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.53 
 
 		 649 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.25 
 
 		 614 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.15 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.88 
 
 		 613 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.99 
 
 		 601 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.79 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.43 
 
 		 660 aa  183  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  24.38 
 
 		 615 aa  183  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 629 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  24.68 
 
 		 618 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  23.21 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.32 
 
 		 625 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  24.87 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 615 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.01 
 
 		 626 aa  180  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  24.13 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  24.29 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.51 
 
 		 649 aa  176  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  23.89 
 
 		 633 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  23.67 
 
 		 622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.23 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.79 
 
 		 635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.64 
 
 		 629 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.68 
 
 		 648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.8 
 
 		 646 aa  173  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  24.6 
 
 		 629 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  22.4 
 
 		 625 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.42 
 
 		 596 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  23.1 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  22.9 
 
 		 615 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  23.37 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  23.21 
 
 		 645 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  24.43 
 
 		 603 aa  171  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 		 645 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.23 
 
 		 615 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.27 
 
 		 615 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.38 
 
 		 615 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  22.98 
 
 		 629 aa  170  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  24.79 
 
 		 605 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.23 
 
 		 615 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.23 
 
 		 615 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  24 
 
 		 601 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  23.3 
 
 		 645 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  24.27 
 
 		 574 aa  169  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.89 
 
 		 650 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 		 641 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.3 
 
 		 639 aa  167  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.88 
 
 		 625 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  24.26 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  24.26 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  24.67 
 
 		 606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  24.67 
 
 		 606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  22.99 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>