199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1453 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
604 aa  1223    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  45.2 
 
 
601 aa  511  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.94 
 
 
604 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  36.25 
 
 
615 aa  369  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  32.95 
 
 
608 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.16 
 
 
600 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.93 
 
 
603 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  32.5 
 
 
607 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.39 
 
 
605 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  32.95 
 
 
610 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  32.8 
 
 
561 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  31.98 
 
 
599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
612 aa  323  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
608 aa  319  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  31.93 
 
 
599 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
609 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
617 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.21 
 
 
605 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.05 
 
 
608 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 
605 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.65 
 
 
608 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.32 
 
 
603 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  32.08 
 
 
565 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  30.23 
 
 
485 aa  263  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  27.07 
 
 
647 aa  236  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 
613 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.72 
 
 
637 aa  223  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  27.48 
 
 
652 aa  221  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  30.31 
 
 
681 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 
624 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.07 
 
 
613 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.6 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
624 aa  210  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  25.8 
 
 
646 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  25.5 
 
 
615 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  25.61 
 
 
615 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 
618 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  25.64 
 
 
623 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25.53 
 
 
629 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  26.49 
 
 
601 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 
615 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 
603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.73 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  25.04 
 
 
623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.57 
 
 
601 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.19 
 
 
629 aa  190  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 
615 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.92 
 
 
648 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  23.66 
 
 
626 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  23.53 
 
 
629 aa  187  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  23.93 
 
 
633 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.5 
 
 
626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 
625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.28 
 
 
625 aa  185  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  23.67 
 
 
629 aa  184  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.68 
 
 
642 aa  183  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  23.16 
 
 
637 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.85 
 
 
615 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  23.72 
 
 
615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  23.68 
 
 
615 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 
605 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  23.68 
 
 
615 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  24.65 
 
 
629 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
615 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  23.66 
 
 
639 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.33 
 
 
644 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.16 
 
 
626 aa  180  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.25 
 
 
614 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.37 
 
 
603 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.26 
 
 
618 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  25.62 
 
 
648 aa  177  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.8 
 
 
603 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.13 
 
 
603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  26.48 
 
 
481 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 
615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.72 
 
 
606 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  22.04 
 
 
628 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.73 
 
 
649 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
598 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
485 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  22.96 
 
 
641 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.63 
 
 
627 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.82 
 
 
635 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 
606 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.37 
 
 
596 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.4 
 
 
625 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  23.41 
 
 
644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 
620 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.85 
 
 
660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 
620 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  23.04 
 
 
620 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  23.37 
 
 
620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  23.54 
 
 
641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  24.35 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  24.35 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.64 
 
 
667 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  23.34 
 
 
641 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  23.14 
 
 
645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>