167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002201 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  73.98 
 
 
607 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  100 
 
 
561 aa  1164    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  60.25 
 
 
610 aa  701    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  90.02 
 
 
608 aa  1050    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  43.97 
 
 
599 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  43.79 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.75 
 
 
605 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  34.64 
 
 
601 aa  350  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.09 
 
 
604 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 
600 aa  330  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.8 
 
 
604 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.1 
 
 
603 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  33.27 
 
 
609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  30.46 
 
 
615 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.18 
 
 
605 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  35.93 
 
 
485 aa  296  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 
608 aa  293  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
612 aa  292  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.1 
 
 
608 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.92 
 
 
608 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.16 
 
 
603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
617 aa  273  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  29.12 
 
 
605 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  30.41 
 
 
647 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  31.01 
 
 
565 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  31.06 
 
 
652 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  33.62 
 
 
681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.95 
 
 
626 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  26.35 
 
 
629 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.59 
 
 
637 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  26.04 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
480 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  25.87 
 
 
629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.91 
 
 
626 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
628 aa  200  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.44 
 
 
627 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  26.77 
 
 
624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.03 
 
 
633 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.61 
 
 
618 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.09 
 
 
625 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.83 
 
 
641 aa  194  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 
478 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  26.31 
 
 
603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.86 
 
 
613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.7 
 
 
601 aa  191  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.96 
 
 
601 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 
629 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.78 
 
 
601 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.87 
 
 
626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.47 
 
 
644 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.51 
 
 
639 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.43 
 
 
635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.57 
 
 
625 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  25.85 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.23 
 
 
596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.14 
 
 
615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  24.53 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  24.83 
 
 
645 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
623 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.39 
 
 
637 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  25.73 
 
 
629 aa  171  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.16 
 
 
606 aa  170  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
615 aa  170  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  25.86 
 
 
646 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
623 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.22 
 
 
618 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.87 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.04 
 
 
660 aa  166  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.11 
 
 
649 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.37 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  26.56 
 
 
622 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.08 
 
 
650 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.5 
 
 
649 aa  163  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.17 
 
 
603 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.26 
 
 
603 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.17 
 
 
603 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.77 
 
 
596 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  25.31 
 
 
574 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.88 
 
 
642 aa  161  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.7 
 
 
615 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.36 
 
 
646 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.92 
 
 
639 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25.54 
 
 
643 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  25.39 
 
 
605 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.15 
 
 
615 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.15 
 
 
615 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.15 
 
 
615 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.15 
 
 
615 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.6 
 
 
615 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 
620 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 
620 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  24.91 
 
 
644 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 
620 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.45 
 
 
625 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  24.64 
 
 
646 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  24.91 
 
 
620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  25.04 
 
 
622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  24.57 
 
 
663 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.49 
 
 
648 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>