169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00167 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  58.03 
 
 		 610 aa  738    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  90.02 
 
 		 561 aa  1050    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  73.52 
 
 		 607 aa  956    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  100 
 
 		 608 aa  1261    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  44.35 
 
 		 599 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  44.19 
 
 		 599 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 605 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 604 aa  369  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  32.67 
 
 		 601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 609 aa  350  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 604 aa  344  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.25 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.1 
 
 		 600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.16 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  33.5 
 
 		 608 aa  335  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 612 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.97 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  30.73 
 
 		 615 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 		 605 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.64 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  31.7 
 
 		 617 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 603 aa  293  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  35.6 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 647 aa  269  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  32.21 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  31.52 
 
 		 652 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  34.01 
 
 		 681 aa  234  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.86 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  26.66 
 
 		 629 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.53 
 
 		 637 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.33 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.69 
 
 		 627 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 		 628 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  26.05 
 
 		 629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.32 
 
 		 625 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25.68 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26.58 
 
 		 618 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.89 
 
 		 626 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.55 
 
 		 480 aa  213  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  26.69 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.68 
 
 		 613 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.46 
 
 		 601 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.24 
 
 		 629 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 625 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.08 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.48 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.33 
 
 		 601 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.33 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.88 
 
 		 613 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.33 
 
 		 644 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.24 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  24.84 
 
 		 641 aa  200  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.96 
 
 		 478 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  26.54 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 		 623 aa  190  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.54 
 
 		 618 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 		 615 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  26.66 
 
 		 623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 615 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  25.67 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 596 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.71 
 
 		 606 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  26.36 
 
 		 646 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  25.43 
 
 		 644 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  26.48 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  25.24 
 
 		 646 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25.86 
 
 		 643 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.04 
 
 		 638 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.72 
 
 		 620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.72 
 
 		 620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.31 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.31 
 
 		 603 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  23.62 
 
 		 645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  25.54 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.46 
 
 		 650 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 649 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.23 
 
 		 603 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.39 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.04 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.45 
 
 		 639 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.04 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.69 
 
 		 660 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.31 
 
 		 596 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25.04 
 
 		 615 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.84 
 
 		 642 aa  170  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  24.56 
 
 		 629 aa  170  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.48 
 
 		 637 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25.09 
 
 		 620 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.58 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.23 
 
 		 649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.43 
 
 		 622 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  24.3 
 
 		 645 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  23.22 
 
 		 646 aa  164  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  23.92 
 
 		 645 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  24.07 
 
 		 645 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>