182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5110 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  100 
 
 		 485 aa  970    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  61.89 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.16 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  44.68 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  44.17 
 
 		 608 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 612 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  43.54 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  45.82 
 
 		 617 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 609 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  39.58 
 
 		 603 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  40.85 
 
 		 681 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 604 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  34.79 
 
 		 607 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  35.93 
 
 		 561 aa  296  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  36.1 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  34.03 
 
 		 601 aa  294  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 		 600 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.32 
 
 		 605 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 647 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  38.44 
 
 		 605 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  35.6 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  35.77 
 
 		 652 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  31.88 
 
 		 610 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  39.12 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  38.89 
 
 		 599 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 604 aa  250  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.68 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  30.52 
 
 		 613 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.29 
 
 		 637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 615 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 		 615 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 		 620 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 		 620 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.02 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.3 
 
 		 615 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 		 615 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  28.3 
 
 		 615 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.98 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  28.3 
 
 		 615 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  28.84 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  26.17 
 
 		 624 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.52 
 
 		 642 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.75 
 
 		 613 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 618 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  28.76 
 
 		 663 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 615 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.21 
 
 		 485 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  29.08 
 
 		 606 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.95 
 
 		 629 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 624 aa  156  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 629 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 606 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.81 
 
 		 605 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.41 
 
 		 626 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  24.04 
 
 		 641 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  25.46 
 
 		 637 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  24.64 
 
 		 629 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.08 
 
 		 601 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  26.5 
 
 		 629 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 645 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.31 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.27 
 
 		 660 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  29.95 
 
 		 603 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.62 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.88 
 
 		 633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.59 
 
 		 623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 		 639 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.74 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.8 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  23.69 
 
 		 628 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.83 
 
 		 603 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 633 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.01 
 
 		 625 aa  143  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.51 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.24 
 
 		 649 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.1 
 
 		 622 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  23.71 
 
 		 626 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.13 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 641 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  27.21 
 
 		 646 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.04 
 
 		 627 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.19 
 
 		 614 aa  136  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 605 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  24.95 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.51 
 
 		 650 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.07 
 
 		 648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.25 
 
 		 667 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  28.15 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.68 
 
 		 596 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  25.39 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>