More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1756 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1756  CBS  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  49.28 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  46.32 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  46.72 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  47.41 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  47.41 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  46.04 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  48.8 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  44.6 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  46.38 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  47.83 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  44.6 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  44.6 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  45.59 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  43.28 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  43.17 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  43.17 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  43.17 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  47.11 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  44.36 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  47.11 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  44.29 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  46.46 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  41.01 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  41.48 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  42.75 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  42.14 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  49.19 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  42.03 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  39.31 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  40 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  41.3 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  42.75 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  37.78 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  41.04 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  42.86 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  42.48 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  38.06 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  42.15 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  37.68 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  45.45 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  37.98 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  34.88 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.81 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.43 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.92 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.3 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  37.19 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  37.1 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  35.16 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  35.61 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.01 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  35.82 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.07 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.36 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  32.65 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  34.85 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.07 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.52 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  39.25 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  32.8 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 606 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  33.33 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>