More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3159 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  39.52 
 
 
185 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  34.17 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  33.85 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  32.23 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  30.58 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  30.94 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  37.96 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  40 
 
 
704 aa  72.8  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  35.04 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3160  CBS domain containing protein  31.71 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  29.75 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  33.05 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  30 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
609 aa  65.1  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
480 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.08 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  34.58 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  30.43 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.15 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  38.3 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  30.65 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  29.2 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.45 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  31.71 
 
 
666 aa  60.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  31.4 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  29.91 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.13 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
625 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.08 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  29.25 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.91 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  35.4 
 
 
281 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  26.35 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  28.12 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  25.74 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  30.09 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
767 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 
280 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  26.02 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  30.15 
 
 
435 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  35.29 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  30.36 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  30.09 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  30.97 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  30.36 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.96 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  34.26 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  30.09 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  30.09 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.36 
 
 
185 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  30.43 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  30.48 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
291 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  29.06 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  40.21 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1643 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
615 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  30.65 
 
 
357 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
212 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  29.2 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  31.37 
 
 
380 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  26.73 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  29.2 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>